公司簡介
本院前身為「臺灣省立雲林醫院」，於57年奉准興建，至64年正式施工， 65年9月16日 正式成立。由於業務發展，原有之醫療大樓已不敷使用，特陸續爭取興建急診大樓、復健大樓、精神衛生大樓及門診新大樓，並於90年9月將所有舊大樓診間搬至門診新大樓，提供更完善的醫療保健服務。 民國 88年7月1日 為配合臺灣省政府功能業務與組織調整，更名為「行政院衛生署雲林醫院」。民國90年7月臺大醫院醫療團隊進駐，醫療陣容更為堅強，於91年7月通過「區域教學醫院」評鑑，使本院成為雲林地區唯一區域教學醫院。 93年4月1日 起經奉行政院核示，正式改制為「國立臺灣大學醫學院附設醫院雲林分院」，簡稱「臺大醫院雲林分院」，成為臺大醫療體系的一環，原於虎尾籌設之雲林分院則規劃為雲林分院虎尾院區，斗六與虎尾二院區相距約 15公里 ，車程約20分鐘。
本院改制後投入大批專業醫師人力及購置心導管、核磁共振、斷層掃瞄等重大儀器，陸續完成各式心導管檢查和治療、開心手術、腹腔鏡肝癌切除手術等重大醫療服務，並於 93年11月15日 成立雲林縣唯一的「心臟血管醫學中心」。94年陸續完成院內重要空間整修並增設加護病房。95年初影像醫學部引進電腦斷層、血管攝影及磁振掃描等重大設備。95年8月，在肝癌死亡率全臺第一的雲林縣成立「肝膽醫學中心」，提供肝病患者優質的醫療照護；同年9月為達成「預防重於治療」的醫療目標，成立「健康管理中心」，提供便捷、貼心、專業、效率及個別化的健康檢查服務。
本院虎尾院區於96年9月正式啟用，以腫瘤醫學治療為重點，擁有放射腫瘤治療設備（IGRT直線加速器）、影醫檢查設備（ MRI、64切CT）、核醫檢查設備（γ-camera 、 SPECT/CT ）等重大儀器設備及設置門診化療區、腫瘤專屬病床，並於 97年8月1日 成立「腫瘤醫學中心」，提供各式腫瘤醫學治療服務，並成立癌末病人安寧病房。
雲林分院斗六及虎尾兩院區功能有所區隔，但又能互補，往後本院所有同仁將持續以雲嘉地區健康守護為使命，並以正直誠信、視病猶親為核心價值，持續提昇醫療及服務品質，確保民眾健康，讓病患獲得與臺大醫院同品質的服務，成為地方民眾最信賴與愛戴的醫學中心。
◆使 命 雲嘉地區健康守護
◆願 景 成為地方民眾最信賴與愛戴的醫學中心
◆核心價值 正直誠信˙視病猶親